زمینه و هدف: موارد متعددی از شیوع ابولا در جهان ثبت شده که بیشتر آنها برای آفریقای مرکزی بوده است. باتوجه به مرگ ومیر ۵۰ تا ۹۰ درصدی مبتلایان و نبود داروی اختصاصی برای بیماری، نیاز مبرم به واکسنی کارآمد برای کنترل این بیماری وجود دارد. در این مطالعه به طراحی واکسن mRNA ، بررسی بیواینفورماتیک، پیش بینی ساختار و بررسی پاسخ های ایمونولوژی یک پروتئین کایمر پرداخته می شود. مواد و روشها: ژنوم ویروس ابولا پروتئینهای مختلفی را کد میکند. با توجه به نقش عملکردی و حفاظتی گلیکوپروتئین (GP) و نوکلئوپروتئین (NP) از آنها برای طراحی ایمونوژن کایمر استفاده شد درصورتیکه مطالعات دیگر صرفا بر GP تاکید داشته اند. حفاظت شدگی توالیهای پروتئینی و نوکلئوتیدی در گونههای مختلف بررسی شد. همچنین، آلرژنیسیته، آنتی ژنیسیته، سمیت و ویژگیهای فیزیکی و شیمیایی یک پروتئین کایمرحاصل از تلفیق این دو پروتئین، تحت مطالعات بیوانفورماتیک قرار گرفت و ساختار دوم پروتئین کایمرپیش بینی شد. اپی توپهای خطی و فضایی سلول B، MHC-I، MHC-II و TCD4 cell با مطالعات ایمونوانفورماتیک مشخص گردید و پاسخ ایمنی در میزبان پستاندار شبیه سازی شد. سازه واکسن mRNA متناسب با پروتئین کایمرطراحی ، ساختار دوم آن بررسی و توالی آن بهینه سازی شد. یافتهها: پروتئین کایمر طراحی شده یک مولکول ایمونوژن با ویژگیهای فیزیکی و شیمیایی و ساختار دو بعدی مناسب بوده و آلرژن و سمی نمیباشد که با داشتن اپی توپهای متعدد میتواند سیستم ایمنی هومورال و سلولی میزبان را حداقل به مدت یک ماه به طور موثری تحریک کند. واکسن mRNA طراحی شده پایدار بوده و نرخ رونویسی بالا خواهد داشت و به دلیل وجود پروتئین NP در کنار GP میتواند علیه بسیاری از سویهها مورداستفاده قرار گیرد. نتیجهگیری: واکسنmRNA کایمر طراحی شده در محیط کامپیوتری مناسب و موثر بوده و میتواندکاندیدای مناسبی برای مطالعات پیش بالین علیه ویروسابولا باشد. کلمات کلیدی: ابولا، ایمونوانفورماتیک، پروتئین کایمر، واکسن mRNA