1- دانشجوی دکتری، گروه زیستشناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه جامع امام حسین، تهران، ایران 2- دانشجوی دکتری، گروه زیستفناوری و نانوفناوری پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران 3- دکترای تخصصی، گروه میکروبیولوژی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج، ایران 4- دکترای تخصصی، مرکز تحقیقات نانوتکنولوژی، پژوهشکده علوم دارویی و فناوریهای سلامت، دانشگاه علوم پزشکی بقیهالله (عج)، تهران، ایران 5- استاد، مرکز تحقیقات ویروسشناسی کاربردی، پژوهشکده فناوریهای زیستپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بقیهالله (عج،) تهران، ایران ، jafar.salimian@gmail.com
چکیده: (985 مشاهده)
زمینه و هدف:موارد متعددی از شیوع ابولا در جهان ثبت شده که بیشتر آنها برای آفریقای مرکزی بوده است. با توجه به مرگومیر ۵۰ تا ۹۰ درصدی مبتلایان و نبود داروی اختصاصی برای بیماری، نیاز مبرم به واکسن کارآمد برای کنترل این بیماری وجود دارد. در این مطالعه، به طراحی واکسن mRNA، بررسی بیواینفورماتیک، پیشبینی ساختار و بررسی پاسخهای ایمونولوژی نوعی پروتئین کایمر پرداخته میشود. مواد و روشها:ژنوم ویروس ابولا پروتئینهای مختلفی را کد میکند. با توجه به نقش عملکردی و حفاظتی گلیکوپروتئین (GP) و نوکلئوپروتئین (NP) از آنها برای طراحی ایمونوژن کایمر استفاده شد، درصورتیکه مطالعات دیگر صرفاً بر GPتأکید کردهاند. حفاظتشدگی توالیهای پروتئینی و نوکلئوتیدی در گونههای مختلف بررسی شد. همچنین، آلرژنیسیته، آنتیژنیسیته، سمیت و ویژگیهای فیزیکی و شیمیایی پروتئین کایمر حاصل از تلفیق این دو پروتئین تحت مطالعات بیوانفورماتیک قرار گرفت و ساختار دوم پروتئین کایمر پیشبینی شد. اپیتوپهای خطی و فضایی سلول B، MHC-I، MHC-IIو TCD4 cellبا مطالعات ایمونوانفورماتیک مشخص و پاسخ ایمنی در میزبان پستاندار شبیهسازی شد. سازه واکسن mRNAمتناسب با پروتئین کایمر طراحی، ساختار دوم آن بررسی و توالی آن بهینهسازی شد. یافتهها: پروتئین کایمر طراحیشده نوعی مولکول ایمونوژن با ویژگیهای فیزیکی و شیمیایی و ساختار دوبعدی مناسب است و آلرژن و سمی نیست و با داشتن اپیتوپهای متعدد میتواند سیستم ایمنی هومورال و سلولی میزبان را حداقل بهمدت یک ماه بهطور مؤثر تحریک کند. واکسن mRNAطراحیشده پایدار است، نرخ رونویسی بالا دارد و بهدلیل وجود پروتئین NPدر کنار GP، میتواند علیه بسیاری از سویهها استفاده شود. نتیجهگیری:واکسنmRNA کایمر طراحیشده در محیط کامپیوتری مناسب و مؤثر است و میتواند کاندیدای مناسبی برای مطالعات پیشبالین علیه ویروسابولا باشد
rezaei A, Samiei-Abianeh H, Arianzad S A, Olad G, Salimian J. In silico Design and Immunoinformatic Evaluation of a Chimeric mRNA Vaccine Candidate against Ebola Virus. SJKU 2026; 31 (3) URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-8852-fa.html
رضایی امیر، سمیعی حسین، آریان زاد سید اکبر، اولاد غلامرضا، سلیمیان جعفر. طراحی و ارزیابی درونسیلیکویی یک واکسن mRNA کایمریک علیه ویروس ابولا. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي كردستان. 1405; 31 (3)