[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: دوره 23، شماره 6 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1397 ) ::
جلد 23 شماره 6 صفحات 1-9 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تأثیر هسپرتین بر دینامیک مولکولی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim در محیط شبیه سازی شده
جواد صفاری چالشتری1 ، نوید جمالی1 ، احسان حیدری سورشجانی2 ، کیهان قطره سامانی 3
1- گروه بیوشیمی بالینی دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
2- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران
3- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران ، kgsamani@yahoo.com
چکیده:   (1222 مشاهده)
مقدمه: بسیاری از ترکیبات مشتق شده از گیاهان دارویی مانند آنتیاکسیدانها و پلی فنل ها نقش بسزایی در پیشگیری و درمان انواع سرطان ها دارند. یکی از فرایندهای مهار سرطان، فعال کردن مسیر آپوپتوز است و ما قصد داریم در این مطالعه، تأثیر دینامیک مولکولی هسپرتین (Hesperetin (را بر روی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim در محیط شبیهسازیشده بررسی نماییم.
روش کار: اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی و فایل های(Bank Data Protein (PDB سه فاکتور آپوپتوزی Bad ، Bak و Bim را از پایگاه اطلاعاتی org.rcsb.www دریافت کردیم و با استفاده از نرم افزارهای ,2.4.v AutoDock 2.9.1.v VMD و 4.5.4.v Gromacs فرایندهای بهینهسازی، شبیهسازی، اتصال مولکولی و محاسبات دینامیک مولکولی را انجام دادیم.
نتایج: مولکول Bad در اتصال با هسپرتین بیشترین میزان انرژی را آزاد میکند در حالی که تغییرات مربوط به شعاع چرخشی (Gyration of Radius (پروتئین Bad بعد از اتصال هسپرتین کاهش ولی برای پروتئین های Bak و Bim افزایش یافت. بیشترین تغییر ساختار دوم پروتئین مربوط به افزایش میزان ساختار Bent و کاهش میزان ساختار Sheet-β در مولکول Bim بود.
بحث و نتیجه گیری: هسپرتین با تأثیر بر دینامیک مولکولی فاکتور های پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim میتواند فعالیت آنها را تحت تأثیر قرار دهد. هر چند که به نظر میرسد بیشترین تأثیر را در فعال کردن مولکول Bad دارد و با ایجاد تغییر در ساختار دوم پروتئین Bim میتواند منجر به فعال کردن این پروتئین و القاء آپوپتوز شود
 
واژه‌های کلیدی: دینامیک مولکولی، آپوپتوز، هسپرتین
متن کامل [PDF 345 kb]   |   متن کامل (HTML)   (380 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: ۱۳۹۷/۵/۱۶ | پذیرش: ۱۳۹۸/۱/۴ | انتشار: ۱۳۹۸/۱/۴
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Saffari-Chaleshtori J, Jamali N, Heydari E, Ghatreh Samani K. Molecular dynamics simulation study of the effect of hesperetin on pre-apoptotic factors of Bad, Bak, and Bim. SJKU. 2019; 23 (6) :1-9
URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-4291-fa.html

صفاری چالشتری جواد، جمالی نوید، حیدری سورشجانی احسان، قطره سامانی کیهان. بررسی تأثیر هسپرتین بر دینامیک مولکولی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim در محیط شبیه سازی شده. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي كردستان. 1397; 23 (6) :1-9

URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-4291-fa.html



دوره 23، شماره 6 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3937