[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: دوره 23، شماره 6 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1397 ) ::
جلد 23 شماره 6 صفحات 1-9 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تاثیر هسپرتین بر سه فاکتور پیش آپوپتوزی Bad، Bak، و Bim در محیط شبیه سازی شده
جواد صفاری چالشتری1 ، نوید جمالی1 ، احسان حیدری سورشجانی2 ، کیهان قطره سامانی 3
1- گروه بیوشیمی بالینی دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
2- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران
3- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران ، kgsamani@yahoo.com
چکیده:   (749 مشاهده)
مقدمه: بسیاری از ترکیبات مشتق شده از گیاهان دارویی مانند آنتی‌اکسیدان‌ها و پلی فنل ها نقش بسزایی در پیشگیری و درمان انواع سرطان ها دارند. یکی از فرایندهای مهار سرطان، فعال کردن مسیر آپوپتوز است و ما قصد داریم در این مطالعه، تأثیر دینامیک مولکولی هسپرتین (Hesperetin) را بر روی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad، Bak و Bim در محیط شبیه‌سازی‌شده بررسی نماییم.
روش کار: اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی و فایل های PDB (Protein Data Bank)سه فاکتور آپوپتوزی Bad، Bak و Bim را از پایگاه اطلاعاتی www.rcsb.org دریافت کردیم و با استفاده از نرم افزارهای AutoDock v.4.2, VMD v.1.9.2 و Gromacs v.4.5.4 فرایندهای بهینه‌سازی، شبیه‌سازی، اتصال مولکولی و محاسبات دینامیک مولکولی را انجام دادیم.
نتایج: مولکول Bad در اتصال با هسپرتین بیشترین میزان انرژی را آزاد می‌کند در حالی که تغییرات مربوط به شعاع چرخشی (Radius of Gyration) پروتئین  Badبعد از اتصال هسپرتین کاهش ولی برای پروتئین های Bak و Bim افزایش یافت. بیشترین تغییر ساختار دوم پروتئین مربوط به افزایش میزان ساختار Bent و کاهش میزان ساختار β-Sheet در مولکول Bim بود.
بحث و نتیجه‌گیری: هسپرتین با تأثیر بر دینامیک مولکولی فاکتور های پیش آپوپتوزی Bad، Bak و Bim می‌تواند فعالیت آن‌ها را تحت تأثیر قرار دهد. هر چند که به نظر می‌رسد بیشترین تأثیر را در فعال کردن مولکول Bad دارد و با ایجاد تغییر در ساختار دوم پروتئین Bim می‌تواند منجر به فعال کردن این پروتئین و القاء آپوپتوز شود.
 
واژه‌های کلیدی: دینامیک مولکولی، آپوپتوز، هسپریتین
متن کامل [PDF 345 kb]   |   متن کامل (HTML)   (314 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: عمومى
دریافت: ۱۳۹۷/۵/۱۶ | پذیرش: ۱۳۹۸/۱/۴ | انتشار: ۱۳۹۸/۱/۴
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Saffari-Chaleshtori J, Jamali N, Heydari E, Ghatreh Samani K. Insilco study of the effect of hesperetin on three pre-apoptotic factors Bad, Bak, Bim . SJKU. 2019; 23 (6) :1-9
URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-4291-fa.html

صفاری چالشتری جواد، جمالی نوید، حیدری سورشجانی احسان، قطره سامانی کیهان. بررسی تاثیر هسپرتین بر سه فاکتور پیش آپوپتوزی Bad، Bak، و Bim در محیط شبیه سازی شده. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي كردستان. 1397; 23 (6) :1-9

URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-4291-fa.html



دوره 23، شماره 6 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3858