[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اول سایت مجله::
صفحه اول سایت دانشگاه::
اطلاعات مجله::
اعضای دفتر مجله::
نمایه‌های مجله::
آرشیو مقالات::
راهنمای نویسندگان::
راهنمای داوران::
ثبت نام و ارسال مقاله::
امکانات سایت مجله::
واحد علم سنجی دانشگاه::
مقالات مرتبط::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
نظرسنجی
نظر شما در مورد مقالات مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان چیست؟
ضعیف
متوسط
خوب
عالی
   
..
شاخص های استنادی مجله

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations97146029
h-index3927
i10-index251157

 
..
کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی کردستان
AWT IMAGE
..
معاونت تحقیقات و فن آوری
AWT IMAGE
..
SCImago Journal & Country Rank
:: دوره 28، شماره 4 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1402 ) ::
جلد 28 شماره 4 صفحات 76-66 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی SARS-CoV- 2 با تکنیک تکثیر به‌واسطه‌ی حلقه‌ی ایزوترمال معکوس (RT-LAMP)
علی حاجی اسماعیلی قمی1 ، مهتاب نوری فرد 2، رامین حمیدی فراهانی3 ، مهدی شکوری خمارتاش3 ، عباس مروتی4 ، اشکان دیربازیان5 ، پگاه شکیب6
1- مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران
2- مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران ، Mahtab-noorifard@yahoo.com
3- مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی آجا، تهران، ایران.
4- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران.
5- گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران
6- مرکز تحقیقات داروهای گیاهی رازی، دانشگاه علوم پزشکی لرستان، خرم آباد، ایران
چکیده:   (1003 مشاهده)
زمینه و هدف: بیماری کووید-19 یک نگرانی بهداشت جهانی است که نیاز به تست تشخیص سریع کمی دارد. در حال حاضر تکنیک استاندارد برای تشخیص SARS-CoV-2 رونویسی معکوس (qRT-PCR) انجام می‌گیرد. هدف از این مطالعه طراحی روش حساس (RT-LAMP) LAMP برای تشخیص ویروس SARS-CoV-2 بود.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه آزمایشگاهی نمونه بیماران با استفاده از سواب های حنجره، حلق و بینی تهیه و پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، ویروس SARS-CoV-2 با استفاده از روش RT-LAMP مورد ارزیابی قرار گرفت. بدین منظور از پرایمرهای طراحی شده با هدف قرار دادن ژن‌های N و E، حساسیت روش RT-LAMP مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: در این مطالعه 19 نمونه RNA ویروس SARS-CoV-2 مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این مطالعه نشان می‌دهد که برای تشخیص و مشاهده کدورت یا تغییر رنگ فلورسنت و همچنین ژل آگارز الکتروفورز حساسیت بیشتری دارد. برای بررسی تعداد کپی ژن E تست بر روی ژل الکتروفورز آخرین رقت 9-10 و بر اساس نور فلورسنت آخرین رقت قابل  بررسی 8-10 بود که با ژل الکتروفورز 1 کپی و بر اساس فلورسنت 14 کپی را تشخیص می دهد؛ اما در مورد ژن N بر روی ژل تا رقت 10-10 و در اثر نور فلورسنت تا رقت 8-10 قابل بررسی بود که به ترتیب توان تشخیص 1 کپی و 17 کپی را داشتند که با فرمول Chiang محاسبه گردید.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که روش LAMP یک روش ساده، سریع، حساس و خاص که برای تشخیص SARS-CoV-2 است که ممکن است پتانسیل تشخیصی را در آزمایشگاه‌های بالینی بهبود بخشد.
واژه‌های کلیدی: SARS-CoV-2، کووید-19، تکثیر به واسطه‌ی حلقه‌ی ایزوترمال معکوس، ویروس.
متن کامل [PDF 383 kb]   (254 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: میکروبیولوژی
دریافت: 1400/6/12 | پذیرش: 1401/2/20 | انتشار: 1402/7/5
فهرست منابع
1. Flint SJ, Racaniello VR, Rall GF, Hatziioannou T, Skalka AM. Principles of virology, Volume 2: pathogenesis and control: John Wiley & Sons; 2020.
2. Smith EC, Blanc H, Vignuzzi M, Denison MR. Coronaviruses lacking exoribonuclease activity are susceptible to lethal mutagenesis: evidence for proofreading and potential therapeutics. PLoS pathog. 2013;9(8):e1003565.
3. Murray P, Rosenthal K, Pfaller M. Medical microbiology: Elsevier health sciences. 2015.
4. Nal B, Chan C, Kien F, Siu L, Tse J, Chu K, et al. Differential maturation and subcellular localization of severe acute respiratory syndrome coronavirus surface proteins S, M and E. J gen virol. 2005;86(5):1423-34.
5. DeDiego ML, Álvarez E, Almazán F, Rejas MT, Lamirande E, Roberts A, et al. A severe acute respiratory syndrome coronavirus that lacks the E gene is attenuated in vitro and in vivo. J virol. 2007;81(4):1701-13.
6. Cui L, Wang H, Ji Y, Yang J, Xu S, Huang X, et al. The nucleocapsid protein of coronaviruses acts as a viral suppressor of RNA silencing in mammalian cells. J virol. 2015;89(17):9029-43.
7. Woo PC, Lau SK, Lam CS, Lau CC, Tsang AK, Lau JH, et al. Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus. J virol. 2012;86(7):3995-4008.
8. Su S, Wong G, Shi W, Liu J, Lai AC, Zhou J, et al. Epidemiology, genetic recombination, and pathogenesis of coronaviruses. Trends microbiol. 2016;24(6):490-502.
9. El-Tholoth M, Bau HH, Song J. A single and two-stage, closed-tube, molecular test for the 2019 novel coronavirus (COVID-19) at home, clinic, and points of entry. ChemRxiv. 2020.
10. Mori Y, Nagamine K, Tomita N, Notomi T. Detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation. Biochem Biophys Res Commun. 2001;289(1):150-4.
11. Sohrab M, Majidzadeh K,Morovvati A, Soleimani M. Real-Time Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Method for Quantitative Salmonella Typhi Detection Based on ViaB Gene. J Adv Med Biomed Res.2021;2(12).
12. Soleimani M, Morovvati A, Majidzadeh k. Molecular Design Real Time Loop-mediated
13. Isothermal Amplification Method for Rapid Detection of Neisseria Meningitidis. Folia med. 2020; 63(2):221-7.
14. Lamb LE, Bartolone SN, Ward E, Chancellor MB. Rapid detection of novel coronavirus (COVID19) by reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification. PLoS One. 2020; 15(6): e0234682.
15. Iwamoto T, Sonobe T, Hayashi K. Loop-mediated isothermal amplification for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex, M. avium, and M. intracellulare in sputum samples. J clin microbiol. 2003;41(6):2616-22.
16. Inácio J, Flores O, Spencer-Martins I. Efficient identification of clinically relevant Candida yeast species by use of an assay combining panfungal loop-mediated isothermal DNA amplification with hybridization to species-specific oligonucleotide probes. J Clin Microbiol. 2008;46(2):713-20.
17. Dong Y, Wu X, Li S, Lu R, Li Y, Wan Z, et al. Comparative evaluation of 19 reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assays for detection of SARS-CoV-2. Sci rep. 2021;11(1):1-11.
18. Yu L, Wu S, Hao X, Dong X, Mao L, Pelechano V, et al. Rapid detection of COVID-19 coronavirus using a reverse transcriptional loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) diagnostic platform. Clin Chem. 2020;66(7):975-7.
19. Rödel J, Egerer R, Suleyman A, Sommer-Schmid B, Baier M, Henke A, et al. Use of the variplex™ SARS-CoV-2 RT-LAMP as a rapid molecular assay to complement RT-PCR for COVID-19 diagnosis. J Clin Virol. 2020;132:104616.
20. Osterdahl M, Lee K, Ni Lochlainn M, Wilson S, Douthwaite S, Horsfall R, et al. Detecting SARS-CoV-2 at point of care: preliminary data comparing loop-mediated isothermal amplification (LAMP) to PCR. BMC Infect Dis. 2020;20(1):783.
21. Jiang M, Pan W, Arasthfer A, Fang W, Ling L, Fang H, et al. Development and validation of a rapid, single-step reverse transcriptase loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) system potentially to be used for reliable and high-throughput screening of COVID-19. Front Cell Infect Microbiol. 2020;10:331.
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA

Ethics code: IR.AJAUMS.REC.1399.140



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Haji Esmaili Qomi A, Noorifard M, Hamidi Farahani R, Shakori Khomartash M, Morovvati A, Dirbazian A et al . Detection of SARS-CoV-2 by Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) Technique. SJKU 2023; 28 (4) :66-76
URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-6937-fa.html

حاجی اسماعیلی قمی علی، نوری فرد مهتاب، حمیدی فراهانی رامین، شکوری خمارتاش مهدی، مروتی عباس، دیربازیان اشکان و همکاران.. شناسایی SARS-CoV- 2 با تکنیک تکثیر به‌واسطه‌ی حلقه‌ی ایزوترمال معکوس (RT-LAMP). مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي كردستان. 1402; 28 (4) :66-76

URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-6937-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 28، شماره 4 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1402 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 46 queries by YEKTAWEB 4660