دکتر شیرکو ناصری، دکتر ساکو میرزایی، ذکریا وهاب زاده، دکتر محمد باقر خادم عرفان، دکتر بهرام نیکخو، خانم ژیلا بهرامی راد، خانم نگار زمانی، دکتر فردین فتحی،
دوره ۲۷، شماره ۴ - ( ۷-۱۴۰۱ )
چکیده
زمینه و هدف: پروتئین Fam۸۳h یک پروتئین غیر ترشحی است که از طریق N-ترمینال خود با کازئین کیناز ۱ آلفا ۱ (CSNK۱A۱) برهمکنش دارد.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه، دومین‌های C-ترمینال در Fam۸۳hFam۸۳h، در انسان و موش با استفاده از نرم‌افزار I-TASSER برای پیش‌بینی ساختار و عملکرد پروتئین مدل‌سازی شدند. شبیه‌سازی دینامیک مولکولی توسط نسخه۵,۰.۲ نرم افزار گرومکس (GROMACS) برای بررسی رفتارهای پروتئین در طی زمان انجام شد. سپس برای هر مدل پس از انجام شبیه‌سازی مولکولی، آنالیز FEL صورت گرفت و داکینگ پروتئین-پروتئین برای بررسی برهمکنش C-ترمینال پروتئین Fam۸۳h با کراتین-۵ اسکلت سلولی به عنوان مدلی از کراتین سلولی توسط PIPER انجام شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که پروتئین انسانی پایدارتر و فشرده‌تر از موش است. علاوه بر این، ارزیابی برهم کنش بین C ترمینال پروتئین‌های Fam۸۳h و کراتین-۵ در موش نشان داد که آمینواسیدهای آرژنین ۳۷۸، پرولین۳۹۱، سرین ۶۶۳، گلوتامات ۷۱۰ و آرژنین ۹۲۳ در پروتئین Fam۸۳h موش به ترتیب با لوسین۴۷۴،آرژنین۴۱۷، تیروزین۴۵۳، گلوتامات۳۹۷، گلوتامین۳۹۶ و گلوتامات۳۹۰ در کراتین-۵ اسکلت سلولی موش پیوند هیدروژنی ایجاد می‌کنند. پروتئینFam۸۳h انسان و کراتین-۵ انسانی نیز از طریق آمینو اسیدهای تراونین۴۳۳، هیستیدین۴۴۷ و آرژنین۴۷۷ و لوسین۴۷۳، گلایسین۴۷۶، گلوتامات۴۲۰، آرژنین۴۰۷ پیوندهای هیدروژنی تشکیل می دهند.
بحث: طبق مطالعات انجام شده قبلی، پروتئین Fam۸۳h با کراتین اسکلت سلولی برهمکنش داشته و در پیشرفت سرطان نقش دارد. می‌توان نتیجه گرفت که پروتئین Fam۸۳h می‌تواند به طور مستقیم با رشته های کراتین از طریق C-ترمینال خود برهمکنش داشته باشد؛ بنابراین، فرضیه ما درIn-silico ، این است که اختلال در C-ترمینال پروتئین Fam۸۳h ممکن است منجر به اختلال در بسته‌بندی کراتین اسکلت سلولی به عنوان مکانیسمی در پیشرفت سرطان شود.
