[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اول سایت مجله::
صفحه اول سایت دانشگاه::
اطلاعات مجله::
اعضای دفتر مجله::
نمایه‌های مجله::
آرشیو مقالات::
راهنمای نویسندگان::
راهنمای داوران::
ثبت نام و ارسال مقاله::
امکانات سایت مجله::
واحد علم سنجی دانشگاه::
مقالات مرتبط::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
نظرسنجی
نظر شما در مورد مقالات مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان چیست؟
ضعیف
متوسط
خوب
عالی
   
..
شاخص های استنادی مجله

Citation Indices from GS

AllSince 2020
Citations101065523
h-index3926
i10-index259134

 
..
کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی کردستان
AWT IMAGE
..
معاونت تحقیقات و فن آوری
AWT IMAGE
..
SCImago Journal & Country Rank
:: دوره 29، شماره 2 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1403 ) ::
جلد 29 شماره 2 صفحات 37-24 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی بیان ژن مهار کننده متاستاز DPT در سرطان معده انسان
سارا رفیع طاهری1 ، آرزو فرهادی1 ، زهرا شهسوار حقیقی1 ، ابراهیم حضرتی2 ، محمدفواد حیدری3 ، پیمان اصلانی4 ، مژگان محمدی مهر3 ، رضا حیدری5 ، جواد بهروزی6 ، علی زارعی7
1- دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران
2- دانشیار، گروه بیهوشی و مراقبت‌های ویژه، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران
3- استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران
4- استادیار، گروه انگل‌شناسی و قارچ‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران
5- استادیار، مرکز تحقیقات اپیدمیولوژی و پایش سرطان، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران
6- استادیار، گروه فناوری‌های نوین و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران ، jvdbehroozi@gmail.com
7- دانشجوی کارشناسی ارشد، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران
چکیده:   (1184 مشاهده)
زمینه و هدف: کارسینوم معده یکی از شایع‌ترین سرطان‌های انسانی است. به منظور درک فرایند شروع و پیشرفت این سرطان ژن های زیادی مورد بررسی قرار گرفته اند؛ اما مکانسیم دقیق سرطانزایی به طور کامل شناخته شده نیست. درماتوپونتین (DPT) یک پروتئین ماتریکس خارج سلولی است که فرایندهای سلولی فیزیولوژیکی متعددی را تنظیم می‌کند. هدف مطالعه حاضر ارزیابی بیان ژن DPT در سرطان معده است. 
مواد و روش‌ها: نمونه‌های بیوپسی مربوط به 50 بیمار مبتلا به سرطان معده و همچنین بافت مجار نرمال آن ها که با استفاده از عمل جراحی به دست آمده بودند، توسط روش real-time PCR مورد بررسی قرار گرفتند. سپس ما با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیکی تغییرات بیان ژن DPT را در دو کوهورت جداگانه از بیماران مبتلا به سرطان معده بررسی شد. به منظور اطلاع از اثرات بیان سطوح مختلف ژن DPT در میزان بقاء بیماران، آنالیز کاپلان-مایر انجام شد. در نهایت آنالیز جامع برای بیان ژن DPT در 16 سرطان مختلف انجام شد.
یافته‌ها: نتایج تکنیک real-time PCR نشان داد میزان بیان ژن DPT در بافت توموری نسبت به بافت نرمال معده کاهش می‌یابد. همچنین میانگین بیان ژن DPT در مراحل مختلف سرطان معده به طور معنی‌داری کاهش نشان داد. آنالیز مدت زمان بقاء نشان داد که بیان mRNA ژن DPT با بقاء کلی بیماران همبستگی مثبت دارد. همچنین ارتباط معنی‌داری میان بیان ژن DPT و اندازه اولیه تومور مشاهده گردید. بررسی بیان این ژن در 16 سرطان مختلف نشان دهنده کاهش بیان آن در بافت توموری نسبت به بافت نرمال مجاور است.
نتیجه‌گیری: این نتایج پیشنهاد می‌کنند که کاهش بیان ژن DPT در بافت معده، احتمالاً نقش مهمی در ایجاد و پیشرفت سرطان معده دارد.

 
واژه‌های کلیدی: سرطان معده، DPT، بیان ژن، متاستاز
متن کامل [PDF 537 kb]   (364 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: پزشکی مولکولی و ژنتیک
دریافت: 1401/9/7 | پذیرش: 1402/4/20 | انتشار: 1403/4/20
فهرست منابع
1. 1.Joshi SS, Badgwell BD. Current treatment and recent progress in gastric cancer. CA: a cancer journal for clinicians. 2021;71(3):264-79. [DOI:10.3322/caac.21657] [PMID] []
2. Garcia Pelaez J, Barbosa Matos R, Gullo I, Carneiro F, Oliveira C. Histological and mutational profile of diffuse gastric cancer: current knowledge and future challenges. Molecular oncology. 2021;15(11):2841-67. [DOI:10.1002/1878-0261.12948] [PMID] []
3. Machlowska J, Baj J, Sitarz M, Maciejewski R, Sitarz R. Gastric cancer: epidemiology, risk factors, classification, genomic characteristics and treatment strategies. International journal of molecular sciences. 2020;21(11):4012. [DOI:10.3390/ijms21114012] [PMID] []
4. Grabsch HI, Tan P. Gastric cancer pathology and underlying molecular mechanisms. Digestive surgery. 2013;30(2):150-8. [DOI:10.1159/000350876] [PMID]
5. Díaz P, Valenzuela Valderrama M, Bravo J, Quest AF. Helicobacter pylori and gastric cancer: adaptive cellular mechanisms involved in disease progression. Frontiers in microbiology. 2018;9:5. [DOI:10.3389/fmicb.2018.00005] [PMID] []
6. Bouras E, Tsilidis KK, Triggi M, Siargkas A, Chourdakis M, Haidich A-B. Diet and Risk of Gastric Cancer: An Umbrella Review. Nutrients. 2022;14(9):1764. [DOI:10.3390/nu14091764] [PMID] []
7. Marimuthu A, Jacob HK, Jakharia A, Subbannayya Y, Keerthikumar S, Kashyap MK, et al. Gene expression profiling of gastric cancer. Journal of proteomics & bioinformatics. 2011;4(4):74. [DOI:10.4172/jpb.1000170]
8. Behroozi J, Shahbazi S, Bakhtiarizadeh MR, Mahmoodzadeh H. ADAR expression and copy number variation in patients with advanced gastric cancer. BMC gastroenterology. 2020;20(1):1-9. [DOI:10.1186/s12876-020-01299-8] [PMID] []
9. Behroozi J, Shahbazi S, Bakhtiarizadeh MR, Mahmoodzadeh H. Genome-Wide Characterization of RNA Editing Sites in Primary Gastric Adenocarcinoma through RNA-Seq Data Analysis. International Journal of Genomics. 2020;2020. [DOI:10.21203/rs.3.rs-23058/v1]
10. Tan IB, Ng I, Tai WM, Tan P. Understanding the genetic basis of gastric cancer: recent advances. Expert review of gastroenterology & hepatology. 2012;6(3):335-41. [DOI:10.1586/egh.12.7] [PMID]
11. Ooi CH, Ivanova T, Wu J, Lee M, Tan IB, Tao J, et al. Oncogenic pathway combinations predict clinical prognosis in gastric cancer. PLoS genetics. 2009;5(10):e1000676. [DOI:10.1371/journal.pgen.1000676] [PMID] []
12. Krishnaswamy VR, Korrapati PS. Role of dermatopontin in re-epithelialization: implications on keratinocyte migration and proliferation. Scientific reports. 2014;4(1):1-6. [DOI:10.1038/srep07385] [PMID] []
13. Okamoto O, Fujiwara S. Dermatopontin, a novel player in the biology of the extracellular matrix. Connective tissue research. 2006;47(4):177-89. [DOI:10.1080/03008200600846564] [PMID]
14. Takeda U, Utani A, Wu J, Shinkai H, Adachi E, Koseki H, et al. Targeted disruption of dermatopontin causes abnormal collagen fibrillogenesis. Journal of investigative dermatology. 2002;119(3):678-83. [DOI:10.1046/j.1523-1747.2002.01863.x] [PMID]
15. Sidgwick G, Bayat A. Extracellular matrix molecules implicated in hypertrophic and keloid scarring. Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology. 2012;26(2):141-52. [DOI:10.1111/j.1468-3083.2011.04200.x] [PMID]
16. Yamatoji M, Kasamatsu A, Kouzu Y, Koike H, Sakamoto Y, Ogawara K, et al. Dermatopontin: a potential predictor for metastasis of human oral cancer. International journal of cancer. 2012;130(12):2903-11. [DOI:10.1002/ijc.26328] [PMID]
17. Takeda U, Utani A, Wu J, Adachi E, Koseki H, Taniguchi M, et al. Targeted disruption of dermatopontin causes abnormal collagen fibrillogenesis. J Invest Dermatol. 2002;119(3):678-83. [DOI:10.1046/j.1523-1747.2002.01863.x] [PMID]
18. Liu S, Qiu J, He G, Geng C, He W, Liu C, et al. Dermatopontin inhibits WNT signaling pathway via CXXC finger protein 4 in hepatocellular carcinoma. Journal of Cancer. 2020;11(21):6288. [DOI:10.7150/jca.47157] [PMID] []
19. Guo Y, Li H, Guan H, Ke W, Liang W, Xiao H, et al. Dermatopontin inhibits papillary thyroid cancer cell proliferation through MYC repression. Molecular and cellular endocrinology. 2019;480:122-32. [DOI:10.1016/j.mce.2018.10.021] [PMID]
20. Cui J, Li F, Wang G, Fang X, Puett JD, Xu Y. Gene-expression signatures can distinguish gastric cancer grades and stages. PloS one. 2011;6(3):e17819. [DOI:10.1371/journal.pone.0017819] [PMID] []
21. Clough E, Barrett T. The gene expression omnibus database. Statistical genomics: Springer; 2016. p. 93-110. [DOI:10.1007/978-1-4939-3578-9_5] [PMID] []
22. Kim D, Langmead B, Salzberg SL. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. Nature methods. 2015;12(4):357. [DOI:10.1038/nmeth.3317] [PMID] []
23. Ebbert MT, Wadsworth ME, Staley LA, Hoyt KL, Pickett B, Miller J, et al. Evaluating the necessity of PCR duplicate removal from next-generation sequencing data and a comparison of approaches. BMC bioinformatics. 2016;17(7):239. [DOI:10.1186/s12859-016-1097-3] [PMID] []
24. Tomczak K, Czerwińska P, Wiznerowicz M. The Cancer Genome Atlas (TCGA): an immeasurable source of knowledge. Contemporary oncology. 2015;19(1A):A68. [DOI:10.5114/wo.2014.47136] [PMID] []
25. Szász AM, Lánczky A, Nagy Á, Förster S, Hark K, Green JE, et al. Cross-validation of survival associated biomarkers in gastric cancer using transcriptomic data of 1,065 patients. Oncotarget. 2016;7(31):49322. [DOI:10.18632/oncotarget.10337] [PMID] []
26. Morris LG, Chan TA. Therapeutic targeting of tumor suppressor genes. Cancer. 2015;121(9):1357-68. [DOI:10.1002/cncr.29140] [PMID] []
27. Liu Y, Wu W, Yiyao W, Han S-S, Yuan Y, Huang J, et al. Recent development of gene therapy for pancreatic cancer using the non-viral nanovectors. Biomaterials Science. 2021. [DOI:10.1039/D1BM00748C] [PMID]
28. Liu X, Meng L, Shi Q, Liu S, Cui C, Hu S, et al. Dermatopontin promotes adhesion, spreading and migration of cardiac fibroblasts in vitro. Matrix Biology. 2013;32(1):23-31. [DOI:10.1016/j.matbio.2012.11.014] [PMID]
29. Lu B, Mahmud H, Maass AH, Yu B, van Gilst WH, de Boer RA, et al. The Plk1 inhibitor BI 2536 temporarily arrests primary cardiac fibroblasts in mitosis and generates aneuploidy in vitro. PloS one. 2010;5(9):e12963. [DOI:10.1371/journal.pone.0012963] [PMID] []
30. Li X, Feng P, Ou J, Luo Z, Dai P, Wei D, et al. Dermatopontin is expressed in human liver and is downregulated in hepatocellular carcinoma. Biochemistry (Moscow). 2009;74(9):979-85. [DOI:10.1134/S0006297909090053] [PMID]
31. Huang H, Hao Z, Long L, Yin Z, Wu C, Zhou X, et al. Dermatopontin as a potential pathogenic factor in endometrial cancer. Oncology Letters. 2021;21(5):1-8. https://doi.org/10.3892/ol.2020.12051 https://doi.org/10.3892/ol.2020.12053 https://doi.org/10.3892/ol.2021.12669 [DOI:10.3892/ol.2020.12075] [PMID] []
32. Khan I, Steeg PS. Metastasis suppressors: functional pathways. Laboratory investigation. 2018;98(2):198-210. [DOI:10.1038/labinvest.2017.104] [PMID] []
33. Baylin SB, Jones PA. A decade of exploring the cancer epigenome-biological and translational implications. Nature Reviews Cancer. 2011;11(10):726-34. [DOI:10.1038/nrc3130] [PMID] []
34. Fu Y, Feng M-X, Yu J, Ma M-Z, Liu X-J, Li J, et al. DNA methylation-mediated silencing of matricellular protein dermatopontin promotes hepatocellular carcinoma metastasis by α3β1 integrin-Rho GTPase signaling. Oncotarget. 2014;5(16):6701. [DOI:10.18632/oncotarget.2239] [PMID] []
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA

Ethics code: IR.AJAUMS.REC.1400.278



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Rafi Taheri S, Farhadi A, Shahsavar Haghighi Z, Hazrati E, Mohammad F H, Aslani P, et al . Evaluation of DPT Metastasis Suppressor Gene Expression in Human Gastric Cancer. SJKU 2024; 29 (2) :24-37
URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-7697-fa.html

رفیع طاهری سارا، فرهادی آرزو، شهسوار حقیقی زهرا، حضرتی ابراهیم، حیدری محمدفواد، اصلانی پیمان، و همکاران. و همکاران.. ارزیابی بیان ژن مهار کننده متاستاز DPT در سرطان معده انسان. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي كردستان. 1403; 29 (2) :24-37

URL: http://sjku.muk.ac.ir/article-1-7697-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 29، شماره 2 - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان 1403 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 46 queries by YEKTAWEB 4710