Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences

fa ارزیابی بیان ژن مهار کننده متاستاز DPT در سرطان معده انسان Evaluation of DPT Metastasis Suppressor Gene Expression in Human Gastric Cancer پزشکی مولکولی و ژنتیک Molecular Medicine and Genetics پژوهشي اصیل Original Research زمینه و هدف: کارسینوم معده یکی از شایع‌ترین سرطان‌های انسانی است. به منظور درک فرایند شروع و پیشرفت این سرطان ژن های زیادی مورد بررسی قرار گرفته اند؛ اما مکانسیم دقیق سرطانزایی به طور کامل شناخته شده نیست. درماتوپونتین (DPT) یک پروتئین ماتریکس خارج سلولی است که فرایندهای سلولی فیزیولوژیکی متعددی را تنظیم می‌کند. هدف مطالعه حاضر ارزیابی بیان ژن DPT در سرطان معده است.  مواد و روش‌ها: نمونه‌های بیوپسی مربوط به 50 بیمار مبتلا به سرطان معده و همچنین بافت مجار نرمال آن ها که با استفاده از عمل جراحی به دست آمده بودند، توسط روش real-time PCR مورد بررسی قرار گرفتند. سپس ما با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیکی تغییرات بیان ژن DPT را در دو کوهورت جداگانه از بیماران مبتلا به سرطان معده بررسی شد. به منظور اطلاع از اثرات بیان سطوح مختلف ژن DPT در میزان بقاء بیماران، آنالیز کاپلان-مایر انجام شد. در نهایت آنالیز جامع برای بیان ژن DPT در 16 سرطان مختلف انجام شد. یافته‌ها: نتایج تکنیک real-time PCR نشان داد میزان بیان ژن DPT در بافت توموری نسبت به بافت نرمال معده کاهش می‌یابد. همچنین میانگین بیان ژن DPT در مراحل مختلف سرطان معده به طور معنی‌داری کاهش نشان داد. آنالیز مدت زمان بقاء نشان داد که بیان mRNA ژن DPT با بقاء کلی بیماران همبستگی مثبت دارد. همچنین ارتباط معنی‌داری میان بیان ژن DPT و اندازه اولیه تومور مشاهده گردید. بررسی بیان این ژن در 16 سرطان مختلف نشان دهنده کاهش بیان آن در بافت توموری نسبت به بافت نرمال مجاور است. نتیجه‌گیری: این نتایج پیشنهاد می‌کنند که کاهش بیان ژن DPT در بافت معده، احتمالاً نقش مهمی در ایجاد و پیشرفت سرطان معده دارد.   Background and Aim: Gastric carcinoma (GC) is one of the most common human cancers. Many genes have been analyzed in an attempt to better understand the process of gastric carcinogenesis, however, the underlying mechanism of gastric carcinogenesis is still poorly understood. Dermatopontin (DPT) is an extracellular matrix protein, which regulates multiple physiological processes. The present study aimed to evaluate DPT gene expression in GC. Materials and Methods: Biopsies of 50 surgically-excised GC tissue specimens and corresponding adjacent normal tissues were examined by real-time PCR. Then, using a bioinformatics analysis we determined DPT gene expression in two different cohorts of GC patients. To determine the effect of DPT expression levels on survival outcome, a Kaplan–Meier analysis was performed. For a comprehensive analysis, DPT gene expression was evaluated in 16 different cancers. Results: RT-PCR demonstrated that DPT gene expression was decreased in gastric cancer tissues, compared to that in the normal stomach tissues. Mean DPT expression value was significantly lower in different stages of GC. Further, survival analysis revealed that the mRNA expression of DPT is positively correlated with overall survival of GC patients. A relationship was found between DPT expression and primary size of tumor. Pan-cancer analysis in 16 tumor types showed that DPT expression was lower in tumor tissue than in the adjacent normal tissue. Conclusion: These findings suggested that the decrease in DPT gene expression in gastric tissue may play an important role in gastric carcinogenesis.   سرطان معده, DPT, بیان ژن, متاستاز Gastric cancer, DPT, Gene expression, Metastasis 24 37 http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-7121-1&slc_lang=fa&sid=1 Sara Rafi Taheri سارا رفیع طاهری covidgalaxy1@gmail.com 5400319475328460063266 5400319475328460063266 No MSc student, Department of Genetics and Biotechnology, Faculty of Life Science, Varamin- Pishva Branch, Islamic Azad University, Varamin, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران Arezoo Farhadi آرزو فرهادی javadindileki@gmail.com 5400319475328460063267 5400319475328460063267 No MSc student, Department of Genetics and Biotechnology, Faculty of Life Science, Varamin- Pishva Branch, Islamic Azad University, Varamin, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران Zahra Shahsavar Haghighi زهرا شهسوار حقیقی geneticsbehroozi@gmail.com 5400319475328460063268 5400319475328460063268 No MSc student, Department of Genetics and Biotechnology, Faculty of Life Science, Varamin- Pishva Branch, Islamic Azad University, Varamin, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد ورامین- پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران Ebrahim Hazrati ابراهیم حضرتی dr.hazrati.e@gmail.com 5400319475328460063269 5400319475328460063269 No Associated professor, Department of Anesthesiology and Critical Care, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran دانشیار، گروه بیهوشی و مراقبت‌های ویژه، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Foad Heidari Mohammad محمدفواد حیدری Foad.312@gmail.com 5400319475328460063270 5400319475328460063270 No Assistant professor, Department of Medical Laboratory Sciences, School of Allied Health Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Peyman Aslani پیمان اصلانی peymanaslani@yahoo.com 5400319475328460063271 5400319475328460063271 No Assistant professor, Department of Parasitology and Mycology, Faculty of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran استادیار، گروه انگل‌شناسی و قارچ‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Mojgan Mohammadimehr مژگان محمدی مهر mojganmehr20@yahoo.com 5400319475328460063272 5400319475328460063272 No Assistant professor, Department of Medical Laboratory Sciences, School of Allied Health Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran استادیار، گروه علوم آزمایشگاهی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Reza Heidari رضا حیدری r-heidary@ajaums.ac.ir 5400319475328460063273 5400319475328460063273 No Assistant professor, Research Center for Cancer Screening and Epidemiology, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran استادیار، مرکز تحقیقات اپیدمیولوژی و پایش سرطان، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Javad Behroozi جواد بهروزی jvdbehroozi@gmail.com 5400319475328460063274 5400319475328460063274 Yes Assistant professor, Department of Genetics and Advanced Medical Technology, Faculty of Medicine, AJA University of Medical Sciences, Tehran, Iran استادیار، گروه فناوری‌های نوین و ژنتیک، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران Ali Zarei علی زارعی alizareiii0018@gmail .com 5400319475328460063275 5400319475328460063275 No MSc student, Medical Biotechnology, AJA Research Center University of Medical Sciences, Tehran, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارتش، تهران، ایران