Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences

fa همراهی چندشکلی (rs920778 C>T) HOTAIR در استعداد ابتلا به سرطان تیروئید در منطقه شمال غرب ایران Association of HOTAIR (rs920778 C>T) Polymorphism with Thyroid Cancer Susceptibility in the Northwest of Iran پزشکی مولکولی و ژنتیک Molecular Medicine and Genetics پژوهشي اصیل Original Research چکیده زمینه و هدف: HOTAIR یک RNA غیرکدکننده بلند است که در جهت آنتیسنس از ژن homebox C (HOXC) رونویسی میشود و نقش انکوژنیک دارد. این مطالعه با هدف بررسی همراهی چندشکلی HOTAIR (rs920778 C>T) با استعداد ابتلا به سرطان تیروئید در جمعیت شمال غرب ایران انجام شد. مواد و روشها: در این مطالعه مورد-شاهدی، همراهی چندشکلی rs920778 ژن HOTAIR با استعداد ابتلا به سرطان تیروئید در جامعه آماری متشکل از 109 مورد بیمار و 198 فرد سالم با تکنیک PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل داده های حاصل با استفاده از برنامه‌ی آماری آنلاین javastat و نرم‌افزار SPSS نسخه‌ی 26 انجام ‌شد. یافته ها: فراوانی ژنوتیپهای TT، CC و TC در بیماران به ترتیب 46/78 ، 29/35و 23/85 درصد و فراوانی آنها در افراد سالم مورد مطالعه به ترتیب  38/88، 20/20 و 40/90 درصد  بود. تجزیه های آماری نشان دهنده همراهی ژنوتیپ TC با سرطان تیروئید (0/003 =P-value) (0/764- 0/268=, CI 95% 0/452=OR) بود. فراوانی آللهای C و T در بیماران به ترتیب 41/28  و 58/71 درصد بود. در جمعیت کنترل فراوانی آللهای C و T به ترتیب 40/65 و 59/34 درصد بود. همچنین نتایج حاصل نشان دهنده عدم همراهی دو آلل T (0/088 =P-value) و C (0/088 =P-value)  با سرطان تیروئید در شمال غرب ایران بود. نتیجه گیری: بر اساس نتایج حاصل چندشکلی rs920778 C>T میتواند با افزایش ریسک ابتلا به سرطان تیروئید همراهی داشته باشد. ارتباط بین ویژگیهای پاتولوژیکی افراد مبتلا به سرطان تیروئید شامل سن بیماران، درجه تومور، درگیری لنف، سمت درگیر، اندازه تومور، مرحله تومور و نوع بیماری با توزیع ژنوتیپی این SNP معناداری نبود.   ABSTRACT Background and Aim: HOTAIR is a long noncoding RNA, that is transcribed from the antisense strand of the homeobox C gene and acts as an oncogene. The aim of this study was to assess the association of HOTAIR (rs920778 C>T) gene polymorphism with the risk of thyroid cancer in the northwest of Iran. Materials and Methods: In this case-control study we investigated association of HOTAIR (rs920778 C>T) gene polymorphism with thyroid cancer susceptibility in a statistical population consisting of 109 patients and 198 healthy controls by PCR-PFLP. Statistical analysis was performed using javastat online statistics package and SPSS V.26. Results: The frequency rates of TT, CC, and TC genotypes were 46.78%, 29.35%, and 23.85% in the case group, and 38.88%, 20.20%, and 40.90% in the control group respectively. Statistical analysis showed a significant association between TC genotype (p-value=0.003) (OR=0.452, CI 95%=0.268-0.764) and thyroid cancer risk. Also, C and T allele frequency rates, were 41.28% and 58.71% in the case group and 40.65% and 59.34% in the control group respectively. There was no significant relationship between T (p-value=0.088) and C (p-value=0.088) allele frequency rates and thyroid cancer risk in the northwest of Iran.  Conclusion: These findings suggested that rs920778 C>T polymorphism may be associated with increased susceptibility of thyroid cancer in the northwest of Iran. There was no significant association between rs920778C >T polymorphism and patient’s pathological characteristics consisting of age, tumor grade, lymph node involvement, side involved, tumor size, tumor stage and type of thyroid tumor.   چندشکلی تک نوکلوتیدی, سرطان تیروئید, ژن HOTAIR, rs920778, PCR-PFLP Single nucleotide polymorphism, Thyroid cancer, HOTAIR gene, rs920778C>T, PCR-PFLP 1 12 http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-6030-1&slc_lang=fa&sid=1 Majid Khalili Namarvar مجید خلیلی نمرور majid_m777@yahoo.com 5400319475328460051990 5400319475328460051990 No MSc graduate, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Sciences, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran کارشناسی ارشد زیست شناسی سلولی و مولکولی، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران Nasser Pouladi ناصر پولادی srna52@gmail.com 5400319475328460051991 5400319475328460051991 No Associated Professor, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Sciences, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran. دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران. Sara Ghaffarin سارا غفاریان s.ghaffarian@azruniv.ac.ir 5400319475328460051992 5400319475328460051992 Yes Assistant Professor, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Sciences, Azarbaijan Shahid Madani University, Tabriz, Iran استادیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران