fa شناسایی سویه‌های اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک با استفاده از روش Real-time PCR در کودکان زیر 2 سال شهر شیراز عمومى General پژوهشي اصیل Original Research چکیده زمینه و هدف: سویه‌های اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک (ETEC) دومین گروه بزرگ اشریشیا کلی در ارتباط با اسهال و مسئول بیش از 25% از کل بیماری‌های کودکان می‌باشند. هدف از این پژوهش ارزیابی شیوع سویه‌های ETEC و ژن‌های بیماری‌زای آن در کودکان زیر 2 سال در شیراز می‌باشد. روش بررسی: این پژوهش به صورت توصیفی-تحلیلی بر روی 285 نمونه مدفوع اسهالی کودکان زیر 2 سال در شیراز انجام شد. در ابتدا سویه‌های اشریشیا کلی با استفاده از تست‌های بیوشیمیایی استاندارد جداسازی گردیدند. سپس شیوع سویه‌های ETEC و حضور ژن‌های st و lt با استفاده از تکنیک Real-Time PCR و حساسیت آنتی‌بیوتیکی با روش انتشار دیسک (CLSI) مورد بررسی قرار گرفت. یافته‌ها: از مجموع نمونه‌های مورد پژوهش، 49 مورد (17%) اشریشیا کلی تولید کننده اسهال جداسازی گردید که 7 مورد آن (3/14%) مربوط به سویه ETEC بود. از سویه‌های ETEC شناسایی شده، 4 مورد (14/57%) ژن lt، 1 مورد (29/14%) ژن stIa و 2 مورد (57/28%) دارای هر دو ژن lt، stIa بودند. تمامی سویه‌های ETEC نسبت به آنتی‌بیوتیک‌های کلرامفنیکل، آمیکاسین و نیتروفورانتویین حساسیت و نسبت به پنی‌سیلین و ماکرولیدها مقاومت داشتند. نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که سویه‌های اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک در منطقه مورد پژوهش شیوع گسترده‌ای دارند. بنابراین پایش گسترده بیمارستانی این پاتوتیپ با استفاده از روش‌های دقیق مولکولی به ‌منظور ارزیابی شیوع آن در سایر مناطق کشور پیشنهاد می‌گردد. کلید واژه‌ها: اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک، Real-time PCR، نوزادان، مقاومت آنتی‌بیوتیکی وصول مقاله:27/3/91 اصلاحیه نهایی:26/6/91 پذیرش:8/2/92 ABSTRACT Background and Aim: Enterotoxigenic strains of E. coli (ETEC) form the second largest group of diarrheagenic E. coli and are responsible for more than 25% of infantile diseases. The purpose of this study is to assess the prevalence of ETEC strains and their virulence genes in children less than 2 years of age in Shiraz. Material and Methods: This was a cross-sectional study. 285 stool samples were taken from children under 2 years of age with diarrhea in Shiraz. First, E. coli strains were isolated using standard biochemical tests. Then, prevalence of ETEC strains and presence of st and lt genes were evaluated using real-time PCR. Antibiotic susceptibility of the isolates was evaluated by using disc diffusion method. Results: 49 (17%) diarrheagenic E. coli strains were isolated, 7 cases (14/3%) belonged to ETEC strain. Among isolated ETEC strains, 4 (57.14%) had lt, 1 (14.29%) had stIa and 2 strains (28.57%) had both lt and stIa genes. All ETEC strains were susceptible to chloramphenicol, amikacin and nitrofurantoin, but showed resistance to penicillin and macrolides. Conclusion: The results showed high prevalence of ETEC strains in our study area. We recommend hospital-wide surveillance by using molecular techniques to estimate the prevalence of this pathotype in other regions of our country. Key words: Enterotoxigenic E. coli, Real-time PCR, Infants, Antibiotic resistance Received: Jun 17, 2012 Accepted: Apr 28, 2013 Conflict of interest: None declared اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک، Real-time PCR، نوزادان، مقاومت آنتی‌بیوتیکی Enterotoxigenic E. coli, Real-time PCR, Infants, Antibiotic resistance 29 38 http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-400&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad Kargar محمد کارگر mkargar@jia.ac.ir 540031947532846004556 540031947532846004556 Yes Islamic Azad University, Jahrom Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم Pejman Abbasi پژمان عباسی 540031947532846004557 540031947532846004557 No Islamic Azad University, Jahrom Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم Abbas Doosti عباس دوستی 540031947532846004558 540031947532846004558 No Islamic Azad University, Shahrekord Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد Sadegh Ghorbani-Dalini صادق قربانی دالینی 540031947532846004559 540031947532846004559 No Islamic Azad University, Jahrom Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم