علی حاجی اسماعیلی قمی، مهتاب نوری فرد، رامین حمیدی فراهانی، مهدی شکوری خمارتاش، عباس مروتی، اشکان دیربازیان، پگاه شکیب،
دوره ۲۸، شماره ۴ - ( مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان ۱۴۰۲ )
چکیده
زمینه و هدف: بیماری کووید-۱۹ یک نگرانی بهداشت جهانی است که نیاز به تست تشخیص سریع کمی دارد. در حال حاضر تکنیک استاندارد برای تشخیص SARS-CoV-۲ رونویسی معکوس (qRT-PCR) انجام میگیرد. هدف از این مطالعه طراحی روش حساس (RT-LAMP) LAMP برای تشخیص ویروس SARS-CoV-۲ بود.
مواد و روشها: در این مطالعه آزمایشگاهی نمونه بیماران با استفاده از سواب های حنجره، حلق و بینی تهیه و پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، ویروس SARS-CoV-۲ با استفاده از روش RT-LAMP مورد ارزیابی قرار گرفت. بدین منظور از پرایمرهای طراحی شده با هدف قرار دادن ژنهای N و E، حساسیت روش RT-LAMP مورد بررسی قرار گرفت.
یافتهها: در این مطالعه ۱۹ نمونه RNA ویروس SARS-CoV-۲ مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این مطالعه نشان میدهد که برای تشخیص و مشاهده کدورت یا تغییر رنگ فلورسنت و همچنین ژل آگارز الکتروفورز حساسیت بیشتری دارد. برای بررسی تعداد کپی ژن E تست بر روی ژل الکتروفورز آخرین رقت ۹-۱۰ و بر اساس نور فلورسنت آخرین رقت قابل بررسی ۸-۱۰ بود که با ژل الکتروفورز ۱ کپی و بر اساس فلورسنت ۱۴ کپی را تشخیص می دهد؛ اما در مورد ژن N بر روی ژل تا رقت ۱۰-۱۰ و در اثر نور فلورسنت تا رقت ۸-۱۰ قابل بررسی بود که به ترتیب توان تشخیص ۱ کپی و ۱۷ کپی را داشتند که با فرمول Chiang محاسبه گردید.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که روش LAMP یک روش ساده، سریع، حساس و خاص که برای تشخیص SARS-CoV-۲ است که ممکن است پتانسیل تشخیصی را در آزمایشگاههای بالینی بهبود بخشد.