[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اول سایت مجله::
صفحه اول سایت دانشگاه::
اطلاعات مجله::
اعضای دفتر مجله::
نمایه‌های مجله::
آرشیو مقالات::
راهنمای نویسندگان::
راهنمای داوران::
ثبت نام و ارسال مقاله::
امکانات سایت مجله::
واحد علم سنجی دانشگاه::
مقالات مرتبط::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
نظرسنجی
نظر شما در مورد مقالات مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان چیست؟
ضعیف
متوسط
خوب
عالی
   
..
شاخص های استنادی مجله

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations93455729
h-index3827
i10-index246147

 
..
کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی کردستان
AWT IMAGE
..
معاونت تحقیقات و فن آوری
AWT IMAGE
..
SCImago Journal & Country Rank
:: مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان - شماره 4 سال 1403- در حال چاپ ::
برگشت به فهرست مقالات برگشت به فهرست نسخه ها
مهندسی آنزیم دی هیدروکسی بی‌فنیل دی اکسیژناز با هدف بهبود عملکرد آن در حذف آلودگی PCBs: یک مطالعه داکینگ مولکولی
سوسن یزدان خواه1 ، علیرضا ذاکری 2، سعید خلیلی1 ، ابوالفضل جهانگیری3 ، زهرا السادات هاشمی4 ، علیرضا حیدری1
1- دانشگاه تربیت دبیر شهید رجایی
2- دانشگاه تربیت دبیر شهید رجایی ، zakeri@sru.ac.ir
3- دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)
4- جهاد دانشگاهی
چکیده:   (206 مشاهده)
زمینه و هدف:  آلاینده‌های صنعتی  پلی ‌کلرو بی‌فنیل‌ها (PCB)، جزء مهم‌ترین آلاینده‌هایی محیط‌زیست هستند که حذف آن‌ها اهمیت فراوانی دارد. تخریب  PCBs به روش زیستی توسط آنزیم‌های متعدد و طی فرآیندی چند مرحله‌ای، صورت می‌گیرد. یکی از این آنزیم‌ها DHBD(2و3دی هیدروکسی دیول 1و2 دی اکسیژناز) نام داشته و توسط ژن BphC رمزدهی می‌شود. تقویت عملکرد آنزیم و کاهش میل اتصال آنزیم به مهارکننده(ترت بوتانول) موجب بهبود عملکرد آنزیم و افزایش کارایی آن خواهد شد. این تحقیق،  با هدف تقویت آنزیم و تضعیف اثر مهارکننده از طریق جهش در آمینواسیدهای سایت فعال، در فضای بیو انفورماتیک انجام شده است.
مواد و روش­ها: توالی اسیدآمینه‌ای‌ آنزیم از  پایگاه داده UniPprot دریافت و به منظور بررسی توالی‌های مشابه با روش BLAST-PSI، توالی‌های مشابه از گونه‌های نزدیک تا دور پروتئین مورد جست‌وجو قرار گرفت. با انجام هم‌ردیفی چندگانه توالی‌های حاصل از BLAST-PSI ، 250 توالی منطبق گردید. نتایج هم‌ردیفی در آمینواسیدهای جایگاه فعال، نشان داد برخی جایگاه‌ها دارای اسیدآمینه متغیر بوده و به عنوان کاندید جهش‌زایی استفاده گردید. موقعیت مهارکننده  T-Butanol با استفاده از نرم‌افزارDISCOVERY شبیه‌سازی شد.
 یافته‌ها: با داکینگ مولکولی با نرم‌افزار PYRX بین آنزیم وحشی و ماده اولیه انرژی اتصال 2/6- کیلوکالری برمول و برای کاندیدهای جهش‌ها حاصل از هم‌ترازی، فنیل‌آلانین201 به ترئونین(9/6- کیلوکالری برمول) و ترئونین280 به سرین(8/6- کیلوکالری برمول) محاسبه شد.
نتیجه‌گیری: انرژی اتصال منفی‌تر، نشان از پایداری بیشتر این برهم‌کنش در آنزیم جهش یافته دارد. در نتیجه این جهش‌ها توان ارتقا قدرت عملکرد آنزیمی را خواهند داشت. شبیه‌سازی موقعیت مهارکننده و ماده اولیه در آنزیم،  نشان داد که احتمالا فاصله مهارکننده از سایت فعال و ماده اولیه در صورتی مطلوب است که، برهم‌کنش مهارکننده بر روی آمینواسیدهای جایگاه فعال کاهش یافته و در نتیجه پایداری اتصال ماده اولیه بی‌فنیل با آنزیم افزایش یابد. کاهش قدرت مهارکننده باعث افزایش قدرت کاتالیتیکی آنزیم در تخریب PCBs خواهد شد.


 
واژه‌های کلیدی: جهش‌زایی، مهارکننده، بیو انفورماتیک، PCBs
     
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: بیوتکنولوژی
دریافت: 1402/5/16 | پذیرش: 1402/11/17
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
برگشت به فهرست مقالات برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 46 queries by YEKTAWEB 4657