Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences

fa مقایسه الگوی آنتی بیوگرام و فراوانی ژن های اتصالی در سویه های اشرشیاکلی جدا شده از نمونه های جفت شده عفونت ادراری و مدفوع بیماران مراجعه کننده به مراکز درمانی شهر سنندج Comparison of antibiogram patterns and frequency of splicing genes in Escherichia coli strains isolated from paired urinary tract infection and stool samples of patients referred to medical centers in Sanandaj city میکروبیولوژی Microbiology پژوهشي اصیل Original Research زمینه و هدف: مقاومت زیاد باکتری اشرشیا کلی در برابر آنتی‌بیوتیک‌های مختلف و گسترش سریع آن، از مهم‌ترین چالش‌ها در درمان عفونت‌های ناشی از این ارگانیسم است. بررسی نمونه‌های مدفوع و ادرار بیماران می‌تواند در شناسایی منبع عفونت و علت بیماری کمک کند. هدف از این مطالعه، بررسی الگوی مقاومت و فراوانی ژن‌های pap، sfa و afa در سویه‌های اشرشیا کلی جداشده از نمونه‌های ادرار و مدفوع بیماران مبتلابه عفونت‌های دستگاه ادراری (UTI) است. مواد و روش‌ها: این مطالعه به‌صورت مقطعی طراحی شد. پنجاه نمونه ادرار و پنجاه نمونه مدفوع به‌صورت جفتی از بیماران مراجعه‌کننده به آزمایشگاه‌های شهر سنندج گرفته شد. پس از کشت نمونه‌ها و تشخیص قطعی باکتری اشرشیا کلی، حساسیت باکتری‌ها به آنتی‌بیوتیک‌ها با روش انتشار دیسک و حساسیت باکتری‌ها به کلیستین با روش دیسک کلیستین در محیط مولر هینتون براث اندازه‌گیری ‌شد. بررسی فراوانی ژن‌های اتصالی با روش PCR انجام شد. در تحلیل داده‌ها از آزمون‌های کای-اسکوئر و تست فیشر و آزمون مک نمار استفاده شد و سطح معنی‌داربودن تست‌ها 05/0P< در نظر گرفته شد. یافته‌ها: در بررسی آنتی‌بیوگرام نمونه‌های ادرار، مشخص شد که در نمونه‌های ادرار، بیشترین مقاومت به آموکسی‌سیلین، نالیدیکسیک اسید و کوتریموکسازول متعلق بود. همچنین، در بررسی آنتی‌بیوگرام نمونه‌های مدفوع، بیشترین مقاومت به آموکسی سیلین، سفیکسیم و کوتریموکسازول تعلق داشت. نتایج PCR نشان داد که بیشترین فراوانی در نمونه ادرار و مدفوع به ژن pap و کمترین فراوانی عامل اتصال به ژن afa متعلق بود. همچنین، مقایسه نتایج ERIC PCR با ضریب پیرسون 95 درصد نشان داد که 44 نمونه از 50 نمونه جفت‌شده (88 درصد) سویه‌های اشریشیاکلی جداشده از ادرار بیماران مبتلابه عفونت ادراری و مدفوع همان بیماران، به میزان 90 درصد مشابهت ژنتیکی دارند. نتیجه‌گیری: با توجه به افزایش مقاومت به برخی از آنتی‌بیوتیک‌ها و تغییرات گسترده در طیف اثربخشی داروها، بررسی الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی در فواصل منظم ضروری است. همچنین، ژن pap در اتصال باکتری جداشده از نمونه‌های ادرار و مدفوع به سطوح بافت میزبان بیشترین نقش را ایفا می‌کند. Background and Aim: The high resistance of Escherichia coli to various antibiotics and its rapid spread are among the most important challenges in the treatment of infections caused by this organism. Examination of stool and urine samples of patients can help identify the source of infection and the cause of the disease. This study aimed to investigate the resistance pattern and frequency of pap, sfa, and afa genes in Escherichia coli strains isolated from urine and stool samples of patients with urinary tract infections (UTI). Materials and Methods: In this cross-sectional study, 50 urine samples and 50 stool samples were initially taken in pairs from patients referred to laboratories in Sanandaj, Iran. After culturing the samples and definitive diagnosis of Escherichia coli, the sensitivity of the bacteria to antibiotics was measured by the disk diffusion method, and the sensitivity of the bacteria to colistin was measured by the colistin disk method in Mueller-Hinton broth medium. PCR examined the frequency of the junction genes. Chi-square, Fisher's, and McNemar's exact tests were used in data analysis, and the significance level of the tests was considered to be P<0.05. Results: In the study of the antibiogram of urine samples, it was found that in urine samples, the highest resistance was to amoxicillin, nalidixic acid, and cotrimoxazole. Moreover, in the study of the antibiogram of stool samples, the highest resistance belonged to amoxicillin, cefixime, and cotrimoxazole. PCR results showed that the highest frequency in urine and stool samples belonged to the pap gene, and the lowest frequency of the binding factor belonged to the afa gene. Conclusion: Considering the increase in resistance to some antibiotics and the wide changes in the spectrum of drug effectiveness, it is necessary to examine the antibiotic resistance pattern at regular intervals. Furthermore, the pap gene plays the greatest role in the binding of bacteria isolated from urine and stool samples to the surfaces of host tissues. مقاومت آنتی‌بیوتیکی, عفونت ادراری, مدفوع, اشرشیا کلی Antibiotic resistance, Escherichia coli, Stool, Urinary tract infection 0 0 http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-8556-1&slc_lang=fa&sid=1 Kivan Mafakheri کیوان مفاخری mafakheri@gmail.com 5400319475328460074347 5400319475328460074347 No Medical Diagnostic Laboratory, Besat Hospital, Kurdistan University of Medical Sciences, Sanandaj, Iran آزمایشگاه تشخیص پزشکی بیمارستان آموزشی‌درمانی بعثت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران Amjad Ahmadi امجد احمدی microbiology90@gmail.com 5400319475328460074348 5400319475328460074348 No Health Metrics and Evaluation Research Center, Research Institute for Health Development, Kurdistan University of Medical Sciences, Sanandaj, Iran مرکز تحقیقات سنجش و ارزیابی سلامت، پژوهشکده توسعه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران Noshin Abdolmaleki نوشین عبدالملکی omnoshin911@gmail.com 5400319475328460074349 5400319475328460074349 No Medical Diagnostic Laboratory, Besat Hospital, Kurdistan University of Medical Sciences, Sanandaj, Iran آزمایشگاه تشخیص پزشکی بیمارستان آموزشی‌درمانی بعثت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران Arezou Taherpour آرزو طاهرپور rezaeeit93@gmail.com 5400319475328460074350 5400319475328460074350 Yes Zoonoses Research Center, Research Institute for Health Development, Kurdistan University of Medical Sciences, Sanandaj, Iran مرکز تحقیقات زئونوز، پژوهشکده توسعه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران Nasrollah Sohrabi نصرالله سهرابی nsohrabi@kums.ac.ir 5400319475328460074351 5400319475328460074351 No . Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران