|
بررسی تأثیر هسپرتین بر دینامیک مولکولی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim در
محیط شبیه سازی شده
|
جواد صفاری چالشتری1    ، نوید جمالی1 ، احسان حیدری سورشجانی2 ، کیهان قطره سامانی 3 |
1- گروه بیوشیمی بالینی دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شیراز، شیراز، ایران
2- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران
3- مرکز تحقیقات بیوشیمی بالینی، پژوهشکده علوم پایه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد، شهرکرد، ایران ، kgsamani@yahoo.com |
|
|
چکیده: (4156 مشاهده) |
مقدمه: بسیاری از ترکیبات مشتق شده از گیاهان دارویی مانند آنتیاکسیدانها و پلی فنل ها نقش بسزایی در پیشگیری و درمان انواع سرطان ها دارند. یکی از فرایندهای مهار سرطان، فعال کردن مسیر آپوپتوز است و ما قصد داریم در این مطالعه، تأثیر دینامیک مولکولی هسپرتین (Hesperetin (را بر روی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim در محیط شبیهسازیشده بررسی نماییم.
روش کار: اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی و فایل های(Bank Data Protein (PDB سه فاکتور آپوپتوزی Bad ، Bak و Bim را از پایگاه اطلاعاتی org.rcsb.www دریافت کردیم و با استفاده از نرم افزارهای ,2.4.v AutoDock 2.9.1.v VMD و 4.5.4.v Gromacs فرایندهای بهینهسازی، شبیهسازی، اتصال مولکولی و محاسبات دینامیک مولکولی را انجام دادیم.
نتایج: مولکول Bad در اتصال با هسپرتین بیشترین میزان انرژی را آزاد میکند در حالی که تغییرات مربوط به شعاع چرخشی (Gyration of Radius (پروتئین Bad بعد از اتصال هسپرتین کاهش ولی برای پروتئین های Bak و Bim افزایش یافت. بیشترین تغییر ساختار دوم پروتئین مربوط به افزایش میزان ساختار Bent و کاهش میزان ساختار Sheet-β در مولکول Bim بود.
بحث و نتیجه گیری: هسپرتین با تأثیر بر دینامیک مولکولی فاکتور های پیش آپوپتوزی Bad ،Bak و Bim میتواند فعالیت آنها را تحت تأثیر قرار دهد. هر چند که به نظر میرسد بیشترین تأثیر را در فعال کردن مولکول Bad دارد و با ایجاد تغییر در ساختار دوم پروتئین Bim میتواند منجر به فعال کردن این پروتئین و القاء آپوپتوز شود
|
|
| واژه‌های کلیدی: دینامیک مولکولی، آپوپتوز، هسپرتین |
|
|
متن کامل [PDF 345 kb]
|
متن کامل (HTML)
(1373 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل |
موضوع مقاله:
عمومى
دریافت: 1397/5/16 | پذیرش: 1398/1/4 | انتشار: 1398/1/4
|
|
|
|
|
|
