Scientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences

fa الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و ارتباط ژنتیکی اسینتوباکتر بومانی جدا شده از عفونتهای دستگاه تنفسی در غرب ایران Antibiotic resistance pattern and genetic relatedness of Acinetobacter baumannii isolated from respiratory tract infection in western Iran میکروبیولوژی Microbiology پژوهشي اصیل Original Research زمینه و هدف: گسترش اسینتوباکتر بومانی مقاوم به داروی عامل عفونت‌های دستگاه تنفسی، یک چالش درمانی در سراسر جهان می باشد. اهداف این مطالعه، بررسی مقاومت آنتی‌بیوتیکی در سویه های اسینتوباکتر بومانی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت‌های دستگاه تنفسی در غرب ایران و تعیین ارتباط ژنتیکی آنها بود. مواد و روش‌ها: طی چهار ماه (آذر تا اسفند 1399)، ۵۹ ایزوله اسینتوباکتر بومانی از نمونه‌های تنفسی بیماران مبتلا به عفونت دستگاه تنفسی بستری در دو بیمارستان اصلی در شهرهای کرمانشاه و سنندج، غرب ایران جمع‌آوری شد. ایزوله ها از نظر حساسیت ضدمیکروبی توسط روش انتشار از دیسک و حضور ژن‌های اصلی کارباپنماز (متالوبتالاکتامازها و کارباپنمازهای نوع OXA) توسط واکنش زنجیره‌ای پلیمراز بررسی شدند. تیپ بندی مولکولی ایزوله ها توسط روش اجماع بین ژنی تکراری انتروباکتریایی (Enterobacterial repetitive intergenic consensus, ERIC) و به دنبال آن تیپ بندی توالی چند لوکوسی (Multilocus sequence typing, MLST (طرح پاستور) انجام شد. یافته ها: مقاومت به کارباپنم در ایزوله ها بالا بود (5/91%). رایج‌ترین کارباپنماز، ژنblaVIM  (8/89%) و پس از آن ژن‌ blaOXA-24-like (78%) بود. تقریباً نیمی از ایزوله‌ها (2/49%) دارای blaOXA-23-like و 2/10% ایزوله ها دارای blaOXA-58-like بودند. در 3/37% ایزوله ها، ISAba1 در بالادست blaOXA-51-like یافت شد. وجود همزمان ژن‌های نوعOXA  و متالوبتالاکتاماز در 8/89% ایزوله ها مشاهده شد. اکثر ایزوله‌های سنندج در یک ژنوتیپ اصلی گروه‌بندی شدند: کلون D که حاوی ایزوله‌های حساس و مقاوم به کارباپنم بود. بزرگترین کلون شناسایی شده در کرمانشاه (کلون E)، حاوی ایزوله‌های مقاوم به کارباپنم بود. MLST مشخص کرد که برخی از ایزوله های کلون D و کلون E به ترتیب متعلق به تیپ توالی (Sequence type, ST) جدید 2237 و 380 می باشند. نتیجه‌گیری: در این مطالعه، سطح بالایی از مقاومت به کارباپنم و ارتباط ژنتیکی در اسینتوباکتر بومانی جدا شده از عفونت‌های دستگاه تنفسی یافت شد. در حال حاضر، ST380 و ST2237 کلون‌های شایعی نیستند، اما ممکن است کلون‌های نوظهور حامل عوامل مقاومت باشند؛ بنابراین، آگاهی در مورد پیشگیری از گسترش اینST ها در بیمارستان‌ها ممکن است ضروری باشد.   Abstract <a name="_Hlk221703095">Background and Aim:</a> Spread of drug-resistant Acinetobacter baumannii (A. baumannii) causing respiratory tract infections (RTIs) is posing a therapeutic challenge worldwide. The aims of this study were to study the antibiotic resistance in A. baumannii strains isolated from patients with RTIs in western Iran and to determine their genetic relationship. Materials and Methods: During four months (November 2020 to February 2021), 59 A. baumannii isolates were collected from respiratory samples of patients with RTI hospitalized in two main hospitals in Kermanshah and Sanandaj cities, western Iran. Isolates were characterized for antimicrobial susceptibility by disk diffusion method and presence of main carbapenemase genes (metallo beta-lactamases and OXA-type carbapenemases) by polymerase chain reaction. Molecular typing of the isolates was undertaken by Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) followed by multilocus sequence typing (MLST) (Pasteur scheme). Results: The carbapenem resistance was high (91.5%) in isolates. The most common carbapenemase was blaVIM gene (89.8%) followed by blaOXA-24-like gene (78%). Almost half of the isolates (49.2%) harbored the blaOXA-23-like and 10.2% of isolates harbored blaOXA-58-like. In 37.3% of isolates the ISAba1 was found upstream of the blaOXA-51-like. The co-existence of OXA-types and metallo beta-lactamase genes was seen in 89.8% of isolates. Most of the isolates from Sanandaj were grouped into one main genotype: Clone D which contained carbapenem-sensitive and -resistant isolates. The largest clone identified in Kermanshah (Clone E) contained the carbapenem-resistant isolates. MLST identified that some isolates of Clone D and Clone E belong to new sequence type (ST) 2237 and ST380, respectively. Conclusion: In this study a high level of carbapenem resistance and genetic relatedness were found in A. baumannii isolated from RTI. At present, ST380 and ST2237 are not wide-spreading clones, but they might be emerging clones carrying resistance determinants; therefore, awareness about the prevention of spread of these STs in hospitals may be necessary. عفونت‌های دستگاه تنفسی, اسینتوباکتر بومانی, کارباپنم, متالوبتالاکتاماز, تیپ‌بندی باکتریایی Respiratory tract infections, Acinetobacter baumannii, carbapenem, metallo-beta-lactamase, Bacterial typing 22 32 http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-4233-2&slc_lang=fa&sid=1 Mobina Niknian مبینا نیک نیان niknianmobina@gmail.com 5400319475328460071655 5400319475328460071655 No Kurdistan University of Medical Sciences دانشگاه علوم پزشکی کردستان Kambiz Feyzi کامبیز فیضی kambizfeyzi@yahoo.com 5400319475328460071656 0009-0001-9932-0041 No Kurdistan University of Medical Sciences دانشگاه علوم پزشکی کردستان، Bita Bakhshi بیتا بخشی b.bakhshi@modares.ac.ir 5400319475328460071657 5400319475328460071657 No Tarbiat Modares University, Tehran دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Safoura Derakhshan صفورا درخشان sderakhshan76@gmail.com 5400319475328460071658 5400319475328460071658 Yes Kurdistan University of Medical Sciences دانشگاه علوم پزشکی کردستان